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冷凍電鏡在“整合”結(jié)構(gòu)生物學(xué)中的作用.

冷凍電鏡是一個重要的工具,作為“整合”結(jié)構(gòu)生物學(xué)新時代的一部分,它將多種技術(shù)結(jié)合在一起,在細胞和分子水平上構(gòu)建一個更全面的動態(tài)過程。

雖然冷凍技術(shù)更多地被用于解決越來越具有挑戰(zhàn)性的結(jié)構(gòu)生物學(xué)項目,但仍有機會通過自動化來優(yōu)化工作流程和克服瓶頸。

理解生物分子的功能和相互作用是生物化學(xué)的基礎(chǔ)。這些知識為新藥研發(fā)和深入了解傳染病原因奠定了基礎(chǔ)。

冷凍樣品以保護它們免受透射電子顯微鏡(TEM)電子束的影響,使得對從單個生物分子到整個細胞的復(fù)雜生物結(jié)構(gòu)進行研究成為可能。

常見問題與解釋.

為什么冷凍電鏡很重要?

由于能夠提供分辨率越來越高的結(jié)構(gòu)信息,冷凍電鏡迎來了科學(xué)發(fā)現(xiàn)的新時代。硬件和軟件的進步使這項技術(shù)在基礎(chǔ)研究和藥物研發(fā)中得到了更廣泛的應(yīng)用。冷凍電鏡用于對一系列生物樣本進行可視化成像,從大型細胞器(使用冷凍層析成像)一直到接近原子分辨率水平的單顆粒分析。

冷凍電鏡有哪些常用的方法?

目前。主要有三種使用冷凍電鏡的方法,具體包括:

單顆粒分析

單顆粒分析(SPA)是一種成熟的冷凍電鏡技術(shù),允許結(jié)構(gòu)生物學(xué)家在近原子分辨率下研究大分子的詳細結(jié)構(gòu),以揭示豐富的生物學(xué)見解。

冷凍斷層掃描

冷凍電子斷層掃描(cryo-ET)使用分子水平的3D成像來產(chǎn)生關(guān)于單個蛋白質(zhì)及其所處細胞環(huán)境的高分辨率結(jié)構(gòu)和空間信息。

微電子衍射

微電子衍射(MicroED)是一種新興的從納米晶體中確定蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)的方法,將冷凍電鏡樣品制備方法與X射線晶體衍射數(shù)據(jù)分析方法結(jié)合起來。

樣品制備對冷凍電鏡分析的成功有什么影響?

冷凍電鏡的最新技術(shù)進步在獲得更高質(zhì)量的結(jié)構(gòu)方面取得了重大進展,成為結(jié)構(gòu)生物學(xué)家的首選方法。將樣品保存在玻璃態(tài)冰中(玻璃化)通常被認為是冷凍電鏡(Cryo-EM)工作流程的第一步。但是,在制備樣品之前,研究人員必須考慮樣品質(zhì)量,并確定其是否適合高分辨率結(jié)構(gòu)測定。

在開始使用任何冷凍電鏡之前,對這些關(guān)鍵因素和儀器正確的深入理解至關(guān)重要,以確保后續(xù)項目的成功。

<閱讀我們的博客文章,了解單顆粒冷凍電鏡樣品制備的入門知識>

當(dāng)然,高質(zhì)量的樣品制備是常規(guī)冷凍電鏡工作流程中公認的、尚未解決的瓶頸。標準的冷凍電鏡工作流程一個復(fù)雜和重復(fù)過程,包括不同規(guī)格種類的載網(wǎng)冷凍以及之后使用冷凍電鏡篩選高質(zhì)量的樣本。這個過程需要在低溫條件下手工操作小而脆弱的載網(wǎng)。但最終樣本載網(wǎng)的質(zhì)量通常由于人為操作從而導(dǎo)致一致性存在差異。此外,不同研究人員在冷凍電鏡方面的不同經(jīng)驗導(dǎo)致對樣品質(zhì)量“好壞”的判斷存在不一致,這同樣是產(chǎn)生差異的原因。

高分辨率冷凍電鏡測定單顆粒結(jié)構(gòu)的主要障礙之一就是氣液界面效應(yīng)(AWI)。最佳的做法是在處理蛋白樣品溶液時避免由于AWI導(dǎo)致蛋白降解可能產(chǎn)生的氣泡。

在樣品玻璃態(tài)化形成薄層的過程中,氣液界面效應(yīng)(AWI)可能會導(dǎo)致顆粒分子發(fā)生降解和聚集以及取向優(yōu)勢等負面影響。

新的樣品制備方法如何提高獲得成功結(jié)果的概率?

不斷涌現(xiàn)的新樣品制備方法使得在單一平臺上推動流程的優(yōu)化以獲得可重復(fù)的高分辨率結(jié)果成為可能。在給定的樣品濃度、緩沖液和冰厚度的條擬下,如果在快速冷凍的時間范圍內(nèi)能確定樣品的表現(xiàn),則在后續(xù)的步驟中就可以集中解決其他不利影響。Chameleon的方法是解決樣品制備瓶頸問題的一種突破,利用更少的樣品獲得更好的結(jié)果,最終有利于減少整體的實驗成本。

相關(guān)產(chǎn)品.

chameleon?

Chameleon無需濾紙blot,全程利用機械臂實現(xiàn)自動化,可實現(xiàn)載網(wǎng)的
快速冷凍,并且具備基于冰層的厚度進行可視化篩選的能力,從而大大
簡化了整個工作流程。引導(dǎo)式的軟件可簡化儀器的設(shè)置、使用和清潔
過程,從而最大限度地減少人工操作可能導(dǎo)致的樣品損失。

了解產(chǎn)品

Quantifoil?

Quantifoil率先將用于電子顯微鏡的支持膜商業(yè)化,這種膜具有預(yù)定義的孔尺寸、形狀和排列,使用非常方便。

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